اگرچه انفورماتیک پزشکی در دنیا قدمتی دیرین دارد، اما در ایران از اواخر سال ۱۳۷۸، راه‌اندازی شده است هرچند برخی مقوله‌ها، نظیر پروندۀ الکترونیک سلامت (EHR) در کشورهای پیشرفته نیز اخیراً مطرح و به‌طور جدی پیگیری می‌شود.

البته به‌رغم نوپا بودن - با توجه به ماهیت بین‌رشته‌ای آن و ترکیب دو رشتۀ جذاب و کاربردی (کامپیوتر و پزشکی) - مخاطبان و علاقه‌مندان آن به‌سرعت افزایش یافته و تقاضا برای آن بالا بوده است.

از طرفی، وضعیت نسبتاً خوب کشور، در حوزۀ پزشکی و کامپیوتر (به لحاظ نرم‌افزاری و توانمندی‌های متخصصان) و هم‌ترازی نسبی با سایر کشورهای مطرح منطقه و جهان، وضعیت قابل قبولی را برای این رشته در کشور رقم زده است (هرچند که نرخ پیشرفت در این حوزه بالاست و وسعت و تنوع نیازها در کشور گسترده است). انفورماتیک پزشکی، دانش کاربرد کامپیوتر و اطلاعات در علوم پزشکی و سلامت است." و در تعریفی جامع می توان گفت: "انفورماتیک پزشکی دانشی چند رشته ایست که از ترکیب تمام علومی تشکیل شده است و هدف اولیه آنها جمع آوری، نگهداری، تحلیل، و پردازش اطلاعات در حوزه علوم پزشکی وسلامت است. این علوم شامل رشته های مختلفی مانند علوم کامپیوتر وطراحی نرم افزار، دانش اطلاعات  (Information Science)، شناخت شناسی (Cognitive Science)، مهندسی نیاز، مهندسی ارتباطات انسان و کامپیوتر و .... می شود".

با آنکه دانش کامپیوتر و اطلاعات (که با همدیگر دانش انفورماتیک را شکل می دهند) در واقع دو دانش مورد استفاده در تمام علوم امروزی می باشند، ولی از آنجا که علوم مرتبط با پزشکی و سلامت بزرگترین و پیچیده ترین گستره دانش را در دنیای فعلی اطلاعات و دانش فعلی جهان تشکیل می دهند، دانش انفورماتیک پزشکی بصورت دانشی مستقل و آکادمیک شکل گرفته و توسعه یافته است.